云南农业大学发布茶叶多组学综合数据库

记者7日从云南农业大学获悉,该校盛军教授团队近期成功发布茶叶多组学综合数据库,为山茶属遗传育种提供重要的数据支撑和检索分析平台。植物科学领域期刊《植物通讯》发表了相关研究成果。

茶被世界卫生组织推荐为六大健康饮料之首,全世界有超过20亿人饮茶。茶树包含多个物种,如用于制备茶饮的山茶属茶树、观赏用山茶花和油料作物茶油树等。近年来,随着基因组学技术广泛应用,山茶属多组学数据迅猛增长,为茶叶生物学研究带来新机遇和多组学数据整合和利用的新挑战,建立一个综合性数据库支持茶叶基因研究势在必行。

盛军团队长期致力于茶叶基因组、功效成分及功能机理研究,搜集并整合了山茶属多个参考基因组、重测序、转录组等组学数据,并将这些数据整合为8个基础模块,共收集265个种以及714个品种的分类信息,可满足人们对山茶属生物资源信息的了解。

团队中的云南农业大学教授董扬、博士研究生李旭真还提供了包括泛基因组、临沧茶树重测序与土壤宏基因组测序数据三项独立研究,构建并发布了山茶属多组学数据库——Teabase。此外,盛军教授团队还开发了引物设计、基因组浏览器、基因表达查看等一系列实用分析工具,采用大量交互式可视化图表,满足研究学者对基因、变异位点、基因表达等信息的检索、分析、整合以及下载等需求。

据悉,这是世界上首个综合茶叶多组学数据库,收录了大量茶叶相关的多组学数据,一半以上数据为首次发表,包括12个参考基因组和一份泛基因组组装、100份转录组,705份全球茶叶种质资源的遗传信息、1350份云南临沧产区古树茶重测序及对应的448份宏基因组测序数据,上亿条变异数据,为茶叶基础研究和遗传育种提供了重要的数据和平台支持,标志着我国茶叶基因组研究迈向新阶段。

(受访者供图)

(来源:科技日报),信息贵在分享,如涉及版权问题请联系删除

声明:本站所有文章,如无特殊说明或标注,均为本站原创发布。任何个人或组织,在未征得本站同意时,禁止复制、盗用、采集、发布本站内容到任何网站、书籍等各类媒体平台。如若本站内容侵犯了原著者的合法权益,可联系我们进行处理。

给TA打赏
共{{data.count}}人
人已打赏
茶资讯

中国移动云南公司区块链技术让普洱茶从茶园到茶杯质量安全可追溯

2023-8-5 21:56:17

茶资讯

云南景迈山古茶林撑起群众生态致富梦

2023-8-8 22:59:04

0 条回复 A文章作者 M管理员
    暂无讨论,说说你的看法吧
购物车
优惠劵
有新私信 私信列表
搜索